从很早开始，它们就参加了这场战斗。
可以说，真菌对虚民的武器十分了解，并且还会使用一部分也基本全都是脑灵的‘功劳’。
甚至那次海下城市遭受到偷袭，也是因为脑灵告诉了真菌海底城市的位置。
这些脑灵是想把虚民逼到绝路，然后自己统治剩下来的虚民，因此它们不能让真菌把所有的虚民杀光，总得留下足够的数量才行。
这个计划大多数脑灵虚民都知道，因此它们都在迅速地执行着，除了对虚民进行统治这个事情之外，它们最重要的目标就是让自己复苏。
为此它们要启动方块，然后试着使用这些方块去别处，聚集更多的脑灵，但启动方块方面有很多问题。
最初它们通过寻找真菌之中的那些携带奇妙石头的甲虫，抓住它们然后解剖，挖出带着那种奇妙梦境能量的石头。
不过后来有一段时间，脑灵忽然找不到这种甲虫了，于是它们的石头数量也无法增长，同时加上能量会泄露的问题，脑灵无法启动大型的方块。
但是，有那么一个脑灵虚民有一种特别的想法，它们可以到另外一个世界——‘连接世界’去寻找能让它们恢复的物质。
它从真菌入侵开始就在新世界那里一直调整星界之门，试图让它通向连接世界，并且使用特别的方法和在虚民母球的脑灵进行联系。
它认为连接世界有可以让它们恢复‘团体感’的物质，同时也有着许多储藏着梦境能量的东西。
所以到那个地方去是最合适的。
但是，它的想法并不被赞同，因为随便调整星界之门，很容易被发现，而且连接世界也就是一个‘传说’而已。
因为脑灵不再像是以前那般团结，它们会变得有些不理解同伴的想法。
而这个脑灵则没有在意，它继续试着调整星界之门，结果没想到真的连接上了‘连接世界’。
连接上后，它感到了极度的兴奋和激动，但它同时也发现它无法联系在虚民母球的同伴了，并且也不知道怎么调整回来，但是它却偶然发现，连接世界的一种微生物和真菌混合在一起会让真菌产生‘脑’这种兵种。
后来，它又捕捉到了一些信号，发现了教长用来联络虚民母球的另外一扇小星界之门。
那个小门无法让它联系上同类，但它可以利用这些微生物让真菌在那边产生一个脑，随之再让那个脑在虚民母球发送信号给同类就行了。
而且，让真菌产生脑的话，也会让母球那些同伴和真菌交流的过程变得更加容易。
于是，这个脑灵便开始了新的办法，它先是通过实验制造出了一个真菌的脑，这个脑是在新世界那里，并没有被放到母球去。
后来它又试着弄出第二个，第二个没有直接在新世界被造出来，而是它把一些‘原料’给传送到了母球去，让在母球的真菌自己制造出来。
按照它的计划，这个脑在被制造出来的时候，它就会像母球的所有脑灵同伴发送信号，让它们知道，这里已经连接上‘连接世界’，并让它们赶快过来。
这个计划因为教长把脑给找出来了，所以没有成功。
但是，这真的没有成功吗？
似乎并不是这种样子。
……在虚民母球的脑灵，实际上在那个脑生成之后，它们就收到了信号了，而玛雅是在这之后才找到那个脑的。
因此，在母球上的脑灵很快就改变了它们的计划，它们……决定去连接世界。
虽然之前不相信，但那只是建立在不确认连接世界是否真实存在的情况下，但现在确认了，那当然要去那里，因为那里有着更多的机会。
所以，脑灵开始试着和真菌达成更多的协议，而真菌似乎也变得‘聪明’了很多，它们好像能更加迅速地反应真菌的要求。
真菌和脑灵的合作变得更加的简单，脑灵继续给真菌提供大量有关虚民的事情，像是在有一段期间，真菌的巨兽一直能很好地躲避虚民的空军和潜艇攻击，并且到处袭击各处城市，主要是也和脑灵提供的情报有关系。
而脑灵在最后则告诉真菌，虚民要逃离开这里，它们会告诉真菌新的星界之门所在，随之让真菌去袭击它们。
同时，脑灵也出动一个方块帮助真菌来进行袭击，就是那个空投蛋形物的方块。
这个方块是脑灵最近启动的方块里最大的一个，它还能做出不少的事情，但是不能传送，所以无法带脑灵离开。
而脑灵给真菌提供这一切之后，当然也有一些‘要求’，这个要求就是让真菌暂时不要对地下世界进行攻击。